DNA rekombinasyonu, çoklu kromozomlar arasında veya aynı kromozomun farklı bölgeleri arasında genetik materyalin değişimi demektir. Bu sürece genellikle homoloji aracılık eder; yani, kromozomların homolog bölgeleri değişim için hazırlanır ve belli bir seviyeye kadar dizi özdeşliği gereklidir.

En yüksek rekombinasyon yüzdesi %50'dir. Mayoz bölünmede kromozomlar eşlendikten sonra diploid veya autoploid türlerde kromozomlardan sadece ikisi yan yana gelip crossing over meydana gelebilir. Diğer iki kromozom fiziksel olarak yanyana gelemediği için crossing over geçiremez. Bu yüzden rekombinasyon yüzdesi %50'yi geçemez.